在人类细胞中，DNA充满了组蛋白、RNA和染色质相关蛋白，形成粘性凝胶。在任何给定时刻，只有蛋白质组的一个子集可以结合DNA并组织其结构、转录、复制、修复和其他基本分子功能。2025年5月22日，德国弗赖辛慕尼黑工业大学（TUM）生命科学学院Bernhard Kuster团队在Cell（IF 45.5）杂志上发表了题为“The human proteome with direct physical access to DNA”的研究文章，开发了一种“零距离”光交联方法来定量与活细胞中DNA直接接触的蛋白质，这为探索基因组调控开辟了一条直接途径，适用于许多生物体和系统。

探析结论

1、从光敏养育細胞中分离出DNA热塑球脂肪酸

要想剥离光交连淀粉酶质-DNA包覆物采用LC-MS定性数据分析，小说作者建设一堆种男变女纯化方案格式，可从DNA中祛除非你是交连淀粉酶质，仅在照射到时用随时表观遗传组交往丰度DNA交连淀粉酶质。用TRIZOL导出刺绣质并祛除执行死刑获的非交连淀粉酶，但是将其二次溶于以开展RNase转化系统。用mri截段获得的淀粉酶质交连DNA的导出物，在硫氰酸胍中烧沸男变女，并在二硫化硅离心分离柱上轻微干洗以祛除非你是交连淀粉酶质以至顺利完成。用核酸酶清理从DNA中产生光交连淀粉酶，并开展胰淀粉酶酶转化系统采用LC-MS定性数据分析。该手段命名规则为淀粉酶质交连DNA导出或XDNAX。

图1.核营养素热塑DNA拆分或XDNAX步骤图（图源：Trendel, et al., Cell 2025）

2、可就直接交往DNA的蛋清质图谱

将光热塑办法广泛应用于MCF7肿瘤細胞，找到了1,805种侯选人球淀粉酶，在当中1,191种出现于3个或比较多次重叠中。60%的DNA彼此效用组暗含核酸相紧密联系的GO批注，在存在核酸相紧密联系批注的球淀粉酶质中，最主要的影响源自核纤层球淀粉酶，此外是团队上色质团队和肿瘤細胞分裂主义的球淀粉酶质（图2）。

图2 . 可直观接处 DNA 的淀粉酶质（改自：Trendel, et al., Cell 2025）

图3个人小结了DNA上下级之间功能组所隐藏的脂肪酸酶质-DNA介面基本涉及到的核苷酸交连肽。这以及主要是因为（1）球状DNA依照结构设计域、（2）DNA 依照周期性区（IDR）和（3）主要是因为与各种脂肪酸酶质（比如说组脂肪酸酶依照脂肪酸酶）、RNA（比如说剪接细胞）或相剥离 区室（比如说核仁脂肪酸酶）上下级之间功能而形成的大环境靠近。

图3 . 可单独接触的面积 DNA的形式域（改自：Trendel, et al., Cell 2025）

3、一定量受损细胞扰动期内与DNA配合的转录系数

雌抗生素多巴胺受体α（ESR1）驻滞留胞质溶胶中，甚至面临其配体，解锁易位到肿瘤组织膜质，在那边它与什么是基因组中的某区域内整合以修改密码某的转录应用程序。将血清饥饿的MCF7肿瘤组织膜爆出于高含水量雌抗生素（10 nM 17β-雌二醇）4分之五钟，与模拟训练处置的相较比效肿瘤组织膜比效这句话的DNA主动用途组（图4A）。其中的，雌抗生素促进后DNA主动用途组中的ESR1延长了30倍（图4B）。总得来说一，在1,814个酶联免疫法的蛋清质-DNA主动用途中，约有9%提示 出达到2倍的明显影响，并观擦到与ESR1拥有主动用途的蛋清如POLR2A和SMARCA4等（图4B-C）。

图4 雌荷尔蒙处里乳腺纤维癌症膜 DNA 互为用途组的按量相对比较（图源：Trendel, et al., Cell 2025）

总结

深入分析流入dna组的血清酶质以介绍它是怎样才能被读取硬盘并付诸实践教学的，一直都是科研项目技术工艺人员是一个长时的的追求。dna组可及性具体以DNA为机构的角度来通过深入分析，可是，到近年结束，染色剂质凝露中的哪方面的血清酶质与DNA 会出现物理防御上下级能力尚不清晰。用零时间光交连，可察觉到DNA上下级能力组中的基本上都数血清酶质，XDNAX技术工艺将身为血清酶质-DNA上下级能力深入分析的强 软件工具。

拜谱总结ppt

该研究基于LC-MS/MS蛋白质谱开发的XDNAX技术，实现了活细胞内蛋白质与DNA直接相互作用的精准捕获与定量分析，绘制了高分辨率的人类DNA互作蛋白图谱，为解析基因组调控网络提供了全新工具。拜谱生物作为一家国内领先的多组学服务公司，可提供完善成熟的血清质组学、掩盖组学、基础代谢组学、转录组学等多组学产品技术服务体系，整合多组学数据进行深入挖掘分析，全面解析机制机理等，助力高分文章发表。欢迎咨询！

可以参考资料：

Trendel J, Trendel S, Sha S, Greulich F, Goll S, Wudy SI, Kleigrewe K, Kubicek S, Uhlenhaut NH, Kuster B. The human proteome with direct physical access to DNA. Cell. 2025 May 14:S0092-8674(25)00507-0. doi: 10.1016/j.cell.2025.04.037.