草酸钙（CaOx）肾结石是泌尿体统里常见到的常见疾病中的一种。肾企业中CaOx氯化钠晶体过饱满基性岩会引发肾小管生殖细胞受损和凋亡，而引发肾结石的型成。短链人体皮下脂肪酸由胃可以使肠胃内好氧菌细茵进行发酵营养饮食仟维制造，不光在部分区域胃可以使肠胃障壁中起效用，同时在体统横向上也起首要效用。中仅，丁酸是最大量的短链人体皮下脂肪酸，极具消除炎症和免疫抗体缓和效用,本论述浅议丁酸对CaOx肾结石的效用举例说明潜在性靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究，华山专科医院泌尿整形外科吴忠讲解、周子健博后于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果，7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠客座教授、周子健医生在Food and Chemical Toxicology（IF=4.3）上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤，并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因，最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱生物工程与吴忠教授、周子健博士团队再次合作，提供了网络信息临床药理学功能，助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点，为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

本文标题：Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9（Food Chem Toxicol.，IF=4.3，2023.07） 企业的单位：华山门诊 探究相亲对象：大鼠、HK-2组织 分组名称内容：比对组（Con）、模式化组（Model）和丁酸钠组（NaB） 拜谱具备能力：数据网络药理学学检查测量

设想程序流程图图

科研可是

探讨人数第一建设方案大鼠模形，顺利通过内分泌系统生物化指标值和组织结构疾病学染料等探讨方法察觉丁酸能够缩短CaOx模形大鼠肾CaOx硫化锌的转变成和受损，改进CaOx模形大鼠的发炎受损和腐蚀物品的过激表达方法。凡此种种，丁酸还可能够抑制草酸促进的HK-2受损细胞膜受损、腐蚀应激性和受损细胞膜凋亡。 为探究式丁酸构成特征和靶遗传什么是DNA遗传系统，探究员从PubChem获取一个丁酸和丁酸酯的二维和二维构成特征（图1A）。经过PharmMapper服务器库和Uniprot服务器库加工后共建立出119个丁酸靶遗传什么是DNA遗传供进一步推动一个脚印剖析。将遗传什么是DNA遗传文件列表把手机通讯录STRING服务器库，实现PPI系统剖析。Cytoscape给定了排列的前20的交通交通交通核心靶遗传什么是DNA遗传的详细完整系统图，比如CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2（图1B）。他们交通交通交通核心遗传什么是DNA遗传与系统中的其他的遗传什么是DNA遗传均表面出必须的涉及到性，详细说明他们遗传什么是DNA遗传已经充分调动着协作能力。GO和KEGG剖析呈现了丁酸交通交通交通核心遗传什么是DNA遗传的涉及到途经和生态学学职能（图1C）。交通交通交通核心遗传什么是DNA遗传具体与类固醇激素类类回应、阳极防氧化应激能力症状回应、微生物氧受损细胞对类固醇激素类类兴奋的症状以其对咸性化学工业物资的症状有关于。总而言之所讲，他们交通交通交通核心遗传什么是DNA遗传具体通过了阳极防氧化应激能力症状和对微生物氧的生态学症状过程中 ，是肾结石组成管理机制中至关重点的途经，这认为丁酸已经在肾结石中充分调动重点能力。

图1| 丁酸组成部分与靶遗传基因网站进行分析(图源：Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为进一部探索世界丁酸对CaOx肾结石真是切靶人类DNA，实验工作员借助GEO数据显示表格库对GSE73680中健康生活照表与CaOx肾结石用户的人类DNA异同开展了实验。照表组与CaOx结石用户的有效性异同把你想表述出来人类DNA（DEGs）挑选标准规定为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共挑选到3783个人类DNA再次发生有效波动，在这其中3379个（89.4%）人类DNA把你想表述出来调涨，404个（10.6%）人类DNA把你想表述出来降低（图2A）。对DEGs开展聚类算法定量分析定量分析，热图展现了前10个被选中DEGs的二维分块聚类算法定量分析本质特征（图2B）。之后，实验工作员采用GeneCards数据显示表格库工人签别了370个有可能与CaOx肾结石重要性的人类DNA，名列前20位的分析人类DNA举例说明重要性性评价如下图下图2C下图。要找寻到丁酸的治疗CaOx肾结石的至关重要靶点，实验工作员将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石重要性人类DNA加工能够 半个个Venn图。不可能，CYP2C9被知道为丁酸应响CaOx肾结石的隐藏靶点(图2D)。前者，实验工作员还开展了丁酸与CYP2C9的碳原子项目对接，CYP2C9的二个酪氨酸残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸双方效果，氢键能为4.2 kcal/mol（图2E）。 在凭借线上临床药理学预测分析CYP2C9是丁酸应响CaOx肾结石的靶基因组后，探讨拜谱生物还依据内部實驗得知了CYP2C9可拉低草酸介导的HK-2内部的ROS能力、炎症病变软组织损伤和凋亡。

图2| 绝大部分据库综合深入分析分析预测CYP2C9是丁酸功用于CaOx肾结石的靶基因遗传

科研没想到

本深入分析1显示丁酸在身体外和机体均能促使性CaOx肾结石仿真模型的钝化应激性反应和真菌感染不良影响，随即实现网洛药理学学学选择有丁酸不良影响CaOx肾结石的意向靶点——CYP2C9，到最后实现受损组织细胞进行实验可确认CYP2C9在草酸盐介导的HK-2受损组织细胞ROS水准、真菌感染不良影响和凋亡。这样的显示表述丁酸也许 实现促使性CYP2C9来促使性CaOx肾结石的钝化应激性反应，改善真菌感染不良影响。这一个历程中拜谱菌物系统提拱了网洛药理学学学系统售后保障，不仅而且拜谱菌物系统可上升熟透建立完善的染色体组学、蛋清质组学、新陈代谢组学等几组学食品及系统售后保障，感谢致電询问！ 对比毕业论文：Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.