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拜谱新品发布| 免疫肽组,基于质谱的新生抗原鉴定与筛选

发布时间:2024-09-26
T細胞是可以设别肿癌細胞表面层的通常团体相溶性组合体(MHC)呈递的抗原而驱散免疫细胞膜检测抗体功能。MHC I类(MHC-I)团伙与CD8+ T細胞间接之间功能,其呈递的肽通常出于于内源性胞质淀粉酶的淀粉酶酶体吸附,而MHC II类(MHC-II)团伙通常形容于工程专业抗原提呈細胞,与CD4+ T細胞间接之间功能,其呈递的肽出于凭借内体前提条件吸附的胞外和胞内淀粉酶(图1)。为此,设别由MHC团伙呈递的肿癌抗原对待设汁依赖性T細胞设别和消除肿癌細胞的可以有效和应急的肝癌免疫细胞膜检测抗体自然疗法是至关比较重要的。源于质谱(MS)的免疫细胞膜检测抗体肽组学(Immunopeptidomics)是可以从很多細胞系、肿癌团体和键康团体中mtk量、真接评定MHC配合肽。

拜谱生物全新推出免疫肽组拜谱生物,通过MHC抵抗能力含有MHC以及整合肽,使用Orbitrap Astral全新一代高分辨质谱仪检测,直接得到免疫细胞肽回文序列还有翻譯后掩盖信心,提高基因测序的真实度,并采用De novo上上下下测序系统,不依赖现有数据库,更快通量鉴定出MHC上呈递的多肽,发现更多非典型免疫肽,而且丰富的的数据显示分享的内容为医学研究中的新抗原鉴定、免疫治疗和疫苗开发提供支持。欢迎大家咨询!

图1 MHC-I和MHC-II呈递良性肿瘤抗原的路线

(图源:Xie et al.Signal Transduction Targeted Ther. 2023)

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案例库分享

01 考核机制研究分析

本文试题:The nuclear export protein XPO1 provides a peptide ligand for natural killer cells

公布杂志网站:Science Advances IF:11.7 2024

XPO1 (Exportin-1/CRM1)都是种核模拟输出血清,在肺癌中频繁过表答,并且做好为恶性肿瘤引发的控制方面。现如今,靶点XPO1的小分子式正被重复使用临床治疗治疗癌症口服药物。

作者发现XPO1是自然杀伤(NK)细胞的靶标。利用免疫系统肽组学,作者鉴定出一种衍生自XPO1的肽,它可以在人类白细胞抗原- C的背景下被激活的NK细胞受体KIR2DS2识别。该肽可以内源性加工并通过该受体特异性地激活NK细胞。虽然XPO1在癌症中的高表达通常与不良预后相关,但研究发现,如果有NK细胞浸润的证据,特异性癌症(如肝细胞癌)的预后可以大大改善。因此,作者确定XPO1是NK细胞识别的真正的肿瘤抗原,为NK细胞治疗实体瘤的个性化方法提供了机会。

图2 这种出自于XPO1的肽是KIR2DS2的配体

(图源:Blunt, Matthew D et al.,Sci Adv. 2024)

02 肉瘤-免疫性医疗

本文大题目:Development of mesothelioma-specific oncolytic immunotherapy enabled by immunopeptidomics of murine and human mesothelioma tumors

刊发月刊:Nature Communications IF:16.6 2023

梭形上皮细胞肉瘤胸膜间皮瘤(MPM)也是种效果不恰当的的肉瘤样癌性肉瘤。致使涉及的诊治设计方案或缺治愈方法作用,因紧迫需新的诊治攻略。采取其T上皮细胞浸润性,我举个例子MPM也是个该用的诊治性肝癌预苗的要求。

迄今为止,对间皮瘤的研究一直集中在识别分子标记以更好地对该疾病进行分类和表征,对涉及细胞毒性(CD8+) T细胞的治疗靶点知之甚少。在这项研究中,作者利用立于质谱的免役肽组研究了小鼠(AB12细胞系)和人细胞系(H28、MSTO-211H、H2452和JL1)以及患者原发性肿瘤中MPM的抗原呈递景观。作者使用来自人类健康供体和癌症患者的T细胞体外表征了洗脱肽的免疫原性特征。此外,作者选择最有前景的肽搭配PeptiCRAd方法,在雌性小鼠的间皮瘤小鼠模型中测试其疗效。总的来说,作者证明了免疫肽组学分析与溶瘤免疫疗法相结合的使用代表了一种解决不可治疗肿瘤的可行且有效的策略。

图3 梭形细胞肿瘤胸膜间皮瘤天然免疫肽组学判断

(图源:Chiaro, Jacopo et al.,Nat Commun. 2023)

03 真菌mRNA役苗研发

优秀文章题目的:Immunopeptidomics-based design of mRNA vaccine formulations against Listeria monocytogenes

提出刊物:Nature Communications IF:16.6 2023

单核细胞增生李斯特菌是一种导致人类李斯特菌病的食源性细胞内细菌病原体。尽管死亡率高且抗生素耐药性增加,但仍没有临床批准的针对李斯特菌的疫苗可用。为了鉴定新的抗原,作者通过针对质谱的免疫力肽组学来筛选呈现在受感染的人类细胞系表面的李斯特菌肽。在超过15000种人类自身肽中,作者检测到来自42种不同细菌蛋白的68种李斯特菌免疫肽,包括几种已知抗原。呈现在不同细胞系上的肽通常来自相同的细菌表面蛋白,将这些抗原归类为潜在的候选疫苗。在脂质纳米粒mRNA疫苗制剂中编码这些高度呈递的抗原导致特异性CD8+ T细胞应答,并在小鼠的疫苗接种攻击实验中诱导保护。研究结果可以作为开发针对李斯特菌的临床mRNA疫苗的起点,证明了基于质谱的免疫肽组学在下一代细菌疫苗开发中的作用。

图4 在李斯特菌感化的Hela体细胞膜和HCT-116体细胞膜中签定MHC I呈递的抗原肽。

(图源:Mayer, Rupert L et al.,Nat Commun. 2022)

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抗体检测系统的肽组学是球营养物质组学的是一个很快成长的节点,它专一于调查抗体检测系统的系统的中由通常聚集开展相融性结合体(MHC)或人类白癌内部抗原(HLA)碳原子呈递的抗体检测系统的肽。等等抗体检测系统的肽是癌内部单单从表面呈递的肽段,都可以被T癌内部自动识别,得以捕获抗体检测系统的反应迟钝。由于质谱的抗体检测系统的肽组学早已为认定MHC球蛋白酶呈递肽的金基准的办法,都可以就直接认定的有所不同身理和病理学的情形下的有所不同聚集开展和癌内部类行中的抗体检测系统的肽组,比如说实体化瘤或hiv病毒感然的癌内部。

拜谱生物作为国内领先的多组学公司,可提供完善成熟的蛋白酶组学、分解组学、转录组学等多组学产品技术服务体系。全新推出的天然免疫肽组检验的服务,通过MHC抗体特异性富集,高分辨质谱检测结合De novo从头测序技术,要确切且可以带来了免役抗体肽回文序列,遇到非常多非举例免役抗体肽,逐级需求出可信新抗原,有助于医学研究人员理解免疫系统的机制、开发疫苗、个性化癌症免疫疗法以及深入了解各种疾病的发病机制。

基准文献综述

1. Xie N,Shen G,Gao W, et al. Neoantigens: promising targets for cancer therapy. Signal Transduct Target Ther. 2023;8 (1):9. doi:10.1038/s41392-022-01270-x 2. Blunt MD,Fisher H,Schittenhelm RB, et al. The nuclear export protein XPO1 provides a peptide ligand for natural killer cells. Sci Adv. 2024;10 (34):eado6566. doi:10.1126/sciadv.ado6566 3. Chiaro J,Antignani G,Feola S, et al. Development of mesothelioma-specific oncolytic immunotherapy enabled by immunopeptidomics of murine and human mesothelioma tumors. Nat Commun. 2023;14 (1):7056. doi:10.1038/s41467-023-42668-7 4. Mayer RL,Verbeke R,Asselman C, et al. Immunopeptidomics-based design of mRNA vaccine formulations against Listeria monocytogenes. Nat Commun. 2022;13 (1):6075. doi:10.1038/s41467-022-33721-y
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